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棉花枯萎病的防治方法主要有大力推广种植抗病的优良品种；适时播种、起垄种植；轮作换茬、增施有机肥；清除病株、控制病情。在播种前还可以进行种子消毒和土壤处理进行病害预防。在病害发生初期，还可以用化学药剂进行防治
1993年在后的一块净土澳大利亚发现该病害后，该病害已遍布世界各产棉区。在中国，棉花枯萎病的发生危害一度十分猖獗，1970-1985年期间在各大棉区严重发生，并被列为植物检疫对象。随着各地陆续出现，1990年后从植物检疫对象名单中取消
依据代谢物质的有无或多少来显示病原菌侵染植物的过程。荧光蛋白标记病原菌结合激光共聚焦扫描显微镜观察可以揭示在亲和与非亲和状况下病原菌侵染过程的组织学和细胞学特征，可以比较病原菌侵染不同抗性种质的差异或不同小种侵染同一种质的差异。但是尚不清楚孢子如何地粘附到植物表面，是被物理的或化学的信号刺激，还是孢子与植物表面存在着非常专化的相互作用，有待进一步的研究。
刺穿表皮、皮质组织，进入维管束，在导管内生长发育。病菌是由下向上扩展，所以，病株萎蔫先从下部叶片开始，以后逐渐向上发展。病菌还能分泌，干扰植株的代谢作用，致使植株中亡。除土壤带菌外，种子也可传带病菌。植物种子带菌为病害的远距离传播（尤其是新小种的传播）以及甜瓜新种植地区的病害发生提供了重要的甚至是初侵染源。土质黏重、地势低洼、排水不良、耕作粗放、根系生长发育不良也容易造成病害发生。
栾树黄萎病（枯萎病）的损害首先在于对植物叶部的损毁以及对树木形态的影响；其次是高病死率。据有关资料显示，对于栾树来说，从病害中恢复过来的可能性不足30%，而且不足5年的树苗只要枯萎病通常会全部，对于那些生长年代较长的栾树，虽不会完全，但也会使得树木枝条枯死，严重影响景观效果。病菌以菌丝或菌核在病植株残体或土壤中越冬（菌核可单独在土壤中存活多年）。次年生长季借浇水、中耕、地下害虫等传播浸染，通过伤口侵入或根部直接浸染，发病程度与根系所分布的土壤层中的病菌数目成正比。
