书写动作局部特征差异。书写动作局部特征，是书写动作习惯的直接反映。它是书写动作的空间位置特点、动作形态特点、动作顺序特点和若干书写动作所构成的文字整体结构特点的集中表现。书写习惯的特定性，主要表现在书写动作局部特征方面，这也是笔迹鉴定的主要判断依据，它具体包含运笔特征，笔画交叉、搭配、连接特征，字的结构特征，笔顺特征等。
检材笔迹特征的限制形成的差异。
检材与样本之间的差异，有时是因为检材笔迹特征的限制造成的。所谓笔迹特征的限制，是指笔迹特征在反映书写习惯时不可避免地存在着局限性，任何一个笔迹特征都不可能完全、充分的展现书写人的全部书写习惯。这也是为什么在鉴定工作中对检材的数量和质量有一个限度要求的原因。有人宣称通过一个笔画就能鉴定是否某人所写显然是不严肃的。尤其是在检材的数量少，并且其笔迹特征的质量不高、数量也不多的情况下，这种差异便表现得十分明显。
笔者认为，对于这种情况的处理，不仅应当从举证责任的含义及举证责任分配的一般规则来分析，而且应当从合同关系成立、生效、变更、解除、终止及撤销方面的举证责任承担来分析。从举证责任的含义及举证责任分配的一般规则来分析民事法第六十四条款规定：“当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。”《人民关于民事证据的若干规定》