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离子交换柱在使用范围上可分为实验室用离子交换柱、工业用离子交换柱。实验室用交换柱：一般用玻璃制造，柱长度和柱直径之比（L/D）大约为10~30，柱上端一般装塞子，下端是用烧结的玻璃砂板，也可以用玻璃毛、带孔的瓷板、不锈钢板，耐腐蚀的塑料网、布、玻璃布等作为离子交换柱的支座。
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装柱
进行离子交换通常在离子交换柱中进行。离子交换柱一般用玻璃制成，装置交换柱时，先在交换柱的下端铺上一层玻璃丝，灌入少量水，然后倾入带水的树脂，树脂就下沉而形成交换层。装柱时应防止树脂层中存留气泡，以免交换时试液与树脂无法充分接触。树脂高度一般约为柱高的90%。为防止加试液时树脂被冲起，在柱 的上端亦应铺一层玻璃纤维。交换枝装好后，再用蒸馏水洗涤，关上活塞，以备使用。应当注意不能使树脂露出水面，因为树脂露于空气中，当加入溶液时，树脂间隙中会产生气抱，而使交换不完全。交换柱也可以用滴定管代替。
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洗脱
当交换完毕之后，一般用蒸馏水洗去残存溶液，然后用适当的洗脱液进行洗脱。在洗脱过程中、上层被交换的离子先被洗脱下来，经过下层未被交换的树脂时，又可以再度被交换。因此洗脱液中被交换离子的浓度等于零，随着洗脱的进行，洗出液离子浓度逐渐增大，达到之后又逐渐减小，至完全洗脱之后，被洗出之离子浓度又等于零。
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离子交换层析法主要依赖电荷间的相互作用，利用带电分子中电荷的微小差异而进行分离，具有较高
的分离容量。几乎所有的生物大分子都是极性的，都可使其带电，所以离子交换层析法已广泛用于生物大
分子的分离、中等纯化及精制的各个步骤中。