为了使微耕机保持性能，新购微耕机必须进行磨合，使用中的微耕机必须进行定期保养与维护。磨合新购的微耕机开始使用时是磨合阶段，油门不能开得太大，发动机必须中速运行（用档耕作），在运转12小时后，趁热机状态卸下发动机曲轴箱的放油螺塞，放出机油，然后再将螺塞拧紧，从注油口加入足量的新机油，同时也更换传动箱的齿轮油，微耕机工作与传动箱的磨损，致使发动机启动困难，油耗增加，马力下降，严重者造成机器损坏。
检查传动箱的润滑油将微耕机放置在水平地面上，取出传动箱的注油孔螺塞，油位应在注油孔的下边沿，若油位低于注油孔下边沿，应补充清洁的齿轮油，若传动箱内无油或油量不足，传动箱内的齿轮和轴承等会在数分钟内损坏。检查燃油箱中的燃油若燃油不足，应补足燃油，机用号以上的，柴油机用普遍轻柴油，气温在"℃" 0℃以下时，用10号轻柴油。
微耕机的使用与操作运转注意事项
（1） 磨合必须进行多次制动和转向试验，并检查操纵机构是否正常工作。
（2） 磨合结束后，要 趁热放掉柴油机底壳和底中的机油。清洗油底壳和润滑油系统中的零件，清洗滤清器，然后加入新机油，底盘中加入适量柴油，空车低档行驶几分钟进行清洗，以清除磨下来的铁屑。
（3） 检查并拧紧气缸盖螺母及其他螺母、螺钉。
（4） 检查并调整气门间隙、离合器、制动器的自由行程。
（5） 经过大修的手扶微耕机也应进行磨合，磨合规范可规定减半执行。
看地理条件。建议山区、丘陵地区的朋友选择配套动力为风冷柴油机的微耕机。因为它体积小，重量轻，转移方便。
看使用时间。如果购买微耕不对外服务，只是耕作自己田块，使用时间短。可以选择耐高温，经济，转移方便的风冷微耕机。要对外服务的，可选择可靠性高，耐高温的水冷微耕机。
看自身的经济条件。应尽量选质量好的、的。
看自身技术能力。微耕机操作技术简单，但应考虑修理问题。机比柴油机多出电路部份，修理要复杂，风冷柴油机比水冷柴油机结构要简单，修理方便。